La Chiesa di Santa Lucia è situata dopo la cosiddetta Porta Piccola, che costituiva l'antico ingresso nel borgo antico di Cisternino. Costruita nel XVII secolo, è una delle chiese più caratteristiche della cittadina e si presenta a una sola aula. Ha due ingressi, uno centrale con un piccolo rosone, e un altro laterale con una edicola rotonda raffigurante una bella tempera di Santa Lucia, e in corrispondenza di questo ingresso laterale in alto svetta un campanile a vela.
Al suo interno, dietro l'altare si apre una piccola absidiola con alcuni frammenti di affresco risalenti al XVIII secolo: dei pochi frammenti si riesce a distinguere un Cristo benedicente al centro, una raffinata immagine di una santa non riconoscibile sulla destra e sulla sinistra si delinea un volto mutilato difficile da identificare. Sulla nicchia a sinistra dell'altare trova collocazione una statua in carta pesta di Santa Lucia.